Kvarnsjön är en sjö i Botkyrka kommun och Huddinge kommun i Södermanland som ingår i Tyresåns huvudavrinningsområde. Sjön är 7,2 meter djup, har en yta på 0,556 kvadratkilometer och befinner sig 43,1 meter över havet. Äldre namn är Oxnan och Gladökvarnsjön.